Rodrigo Bacellar foi preso durante a terceira fase da Operação Unha e Carne, que investiga o vazamento de informações sigilosas relacionadas a ações contra o Comando Vermelho. A audiência de custódia ocorreu de forma on-line no Presídio José Frederico Marques, em Benfica, para onde Bacellar foi levado após a prisão. Ele foi detido em sua residência em Teresópolis pela Polícia Federal, em cumprimento a um mandado expedido pelo ministro do Supremo Tribunal Federal, Alexandre de Moraes.

Após a prisão, Bacellar foi encaminhado para a Superintendência da Polícia Federal na Zona Portuária do Rio de Janeiro e, em seguida, para o sistema prisional. A operação também incluiu o cumprimento de um mandado de busca e apreensão.

A prisão está vinculada às determinações do Supremo Tribunal Federal no âmbito da ADPF das Favelas, que estabelece obrigações para investigações sobre grupos criminosos. Bacellar já havia sido preso em dezembro do ano anterior na mesma operação, sendo liberado poucos dias depois mediante medidas cautelares, incluindo o uso de tornozeleira eletrônica.

A cassação do mandato do ex-deputado provocará uma recontagem dos votos das eleições de 2022 no Rio de Janeiro, com possibilidade de alteração das vagas na Assembleia Legislativa. A recontagem está prevista para ocorrer em 31 de março.

A defesa de Bacellar classificou a nova prisão como indevida e desnecessária, afirmando que ele vinha cumprindo todas as medidas cautelares e informou que irá contestar e recorrer para que a prisão seja revista e revogada.