Os artrópodes são essenciais para a decomposição da matéria orgânica, o retorno de nutrientes à cadeia alimentar e a polinização de espécies vegetais nativas do Pantanal. Esse grupo inclui caranguejos e camarões, como o camarão-fantasma, aracnídeos como aranhas, opiliões e escorpiões, entre eles o escorpião-vinagre, além dos insetos, que constituem o grupo mais numeroso do planeta.

Apesar da importância desses animais, os estudos sobre insetos e outros invertebrados no Pantanal ainda são limitados, concentrando-se em áreas específicas e não abrangendo toda a biodiversidade do bioma. Essa abelha tem o tórax com pelos castanho-avermelhados e o abdome com cinco faixas amarelas, e ocorre também nos Estados Unidos, Canadá e Ásia.

O camarão-fantasma, inicialmente confundido com o camarão-da-amazônia (Macrobrachium amazonicum), foi identificado como uma espécie nova após estudos que revelaram diferenças morfológicas, anatômicas, fisiológicas e comportamentais em relação ao camarão do bioma amazônico. Esse camarão é noturno, abriga-se em troncos e frestas, e é um importante controlador de pragas, alimentando-se de gafanhotos, baratas e outros insetos.

Já o caranguejo-de-água-doce, ou caranguejo-vermelho, é nativo da América do Sul e muito comum no bioma, sendo amplamente utilizado como isca-viva na pesca esportiva.

A biologia, reprodução e dispersão do caranguejo-de-água-doce estão intimamente ligadas ao pulso de inundação do Pantanal. Essa espécie habita principalmente corpos d'água permanentes, como rios, corixos e lagoas, mas durante as cheias expande sua área para regiões temporariamente alagadas, atraída pela disponibilidade de alimentos como macrófitos aquáticos e matéria orgânica. O período de cheia coincide com a época reprodutiva do caranguejo, quando as condições de temperatura, abrigo e alimento favorecem a eclosão dos ovos e larvas.